Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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