Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms