Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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