Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC8.81□□□□□ -1
LRP1Q07954 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1099.9 ms