Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms