Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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PKD1P98161 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PKD1P98161 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKD1P98161 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
PKD1P98161 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
PKD1P98161 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
PKD1P98161 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
PKD1P98161 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
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PKD1P98161 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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PKD1P98161 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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PKD1P98161 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKD1P98161 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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