Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms