Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VEGFBP49765 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms