Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCC3P46736 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms