Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms