Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA1P42261 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA1P42261 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms