Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC19A1P41440 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC19A1P41440 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC19A1P41440 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms