Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms