Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPI1P17947 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPI1P17947 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPI1P17947 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPI1P17947 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPI1P17947 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPI1P17947 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPI1P17947 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms