Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms