Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMP3P12645 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMP3P12645 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMP3P12645 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMP3P12645 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMP3P12645 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMP3P12645 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMP3P12645 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMP3P12645 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMP3P12645 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BMP3P12645 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMP3P12645 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMP3P12645 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMP3P12645 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMP3P12645 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMP3P12645 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMP3P12645 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMP3P12645 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMP3P12645 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMP3P12645 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMP3P12645 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMP3P12645 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms