Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms