Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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HLA-DQB1P01920 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HLA-DQB1P01920 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HLA-DQB1P01920 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HLA-DQB1P01920 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HLA-DQB1P01920 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HLA-DQB1P01920 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HLA-DQB1P01920 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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HLA-DQB1P01920 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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