Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms