Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms