Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB5A4FU69 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms