Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K4Q9Y6R4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K4Q9Y6R4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K4Q9Y6R4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K4Q9Y6R4 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K4Q9Y6R4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K4Q9Y6R4 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K4Q9Y6R4 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K4Q9Y6R4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K4Q9Y6R4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K4Q9Y6R4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K4Q9Y6R4 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K4Q9Y6R4 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms