Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms