Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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