Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VPS4AQ9UN37 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VPS4AQ9UN37 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VPS4AQ9UN37 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS4AQ9UN37 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VPS4AQ9UN37 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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VPS4AQ9UN37 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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