Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms