Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms