Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PARD6AQ9NPB6 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms