Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms