Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms