Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms