Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms