Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms