Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms