Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms