Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLF2Q8IX21 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms