Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT6

TRIM69, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM69, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM69Q86WT6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM69Q86WT6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms