Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms