Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUSD1Q6UWL2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUSD1Q6UWL2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUSD1Q6UWL2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUSD1Q6UWL2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUSD1Q6UWL2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUSD1Q6UWL2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUSD1Q6UWL2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUSD1Q6UWL2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUSD1Q6UWL2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUSD1Q6UWL2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUSD1Q6UWL2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms