Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITRM1Q5JRX3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms