Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms