Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms