Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms