Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYTL3Q4VX76 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms