Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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