Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms