Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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