Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms