Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms