Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms